整座寺院，飞檐、斗拱、藻井、廊柱，均为砖仿木造型，雕工精细，造型奇特，世所罕见。寺院构局完备，大雄宝殿、三圣阁、客堂、禅堂、配殿和双塔呼应，保存完整，气象恢宏。

　　大雄宝殿是永祚寺中现存最大的殿宇，面阔五间，开间19.35米，进深11.3米，也被称作无梁殿。所谓“无梁殿”，就是整个殿宇不用一根木质的梁、檩、椽、柱，而是用砖石砍磨砌筑的穹隆形建筑。

　　这种穹隆形发券的砖结构建筑，早在千百年前就运用在陵墓和砖塔建筑上。直到十四、十五世纪，即我国的明朝时期，宫殿和寺宇才运用这种建筑形式。之后，这种无需木材的砖砌建筑技术，便成为明代殿堂建筑中新出现的营造特征，并留下了鲜明的时代风格和印记，在中国建筑的发展史上占有了一席重要位置。它是我国明代的建筑匠师们，继承和发展前代建筑技艺而自成一格的技术结晶，显示了华夏劳动人民的智慧和才能。

　　大雄宝殿，四面磨砖对缝，当心间与两次间各辟一门，两稍间为格子棂窗。其外观全为仿木结构而制，用砖雕出斗拱、椽飞等。正面有青砖磨砍砌筑的檐柱六根，平面呈圆形，半径敞露在外，做嵌入墙状。每根檐柱的下部为青砖精心雕琢的仰覆莲须弥座。檐柱与檐柱之间，用砖砌阑额枋相连，其上为砖砌普板枋，枋上置砖雕斗拱，除柱头科外，每间都有平身科两攒，当心间两朵攒平身科中还夹有一攒斜拱。这些砖仿木制的斗拱均为五踩双翘。

　　为了弥补砖仿木结构所造成的柱高、檐短、出跳尺度较小等墙面显得呆板的缺陷，能工巧匠们别出心裁，在檐柱的上端，再雕刻磨砌出垂莲柱、角替、枋头、华板等装饰构件，并在上面精心雕刻出卷草纹，置于阑枋之下，形似于木，而工精于木，如同给大殿披上了半截花罩。

　　此外，能工巧匠们还在垂莲柱与枋头的交接处，用砖雕刻出云纹等，大大加强了墙面的装饰性。

　　无梁式大雄宝殿之上，另建有一座单檐歇山式无梁高阁，原名观音阁，后更名为三圣阁，自大雄宝殿旁侧方丈院内拾级转折而上，便可登。三圣阁面阔三间，长16.75米，进深9.70米。砖制的檐牙高喙、殿角翘檐，好似大鹏展翅，昂首欲飞，有“无梁飞阁”之美称。殿内当心间顶部砖雕砌有庞大的藻井，结构奇妙，斗拱出跳，层层叠涩而上，构成穹隆顶，犹如华盖宝顶，富丽精致。砖似木制，独具匠心，为无梁式殿阁中的珍品。专家们指出：“突出的是顶部砖雕藻井，结构奇特、精巧。在方形平面的四角上，用斗拱出跳，层层叠涩而上，筑成穹隆顶。即在四面发券，做出券门，每角置斗拱一攒，为五踩重翘。在其斗拱上叠涩二层平砖和一层竖砖，与券门顶部取平，使平面由四面变成八面，然后每角置一斗三升承托撩檐枋和椽飞，构成檐出。檐上再置斗拱，每平除角科外，中间增设平身科一攒，均为五踩重翘，斗拱上挑出檐。如此三层，每层斗拱长度向上，逐渐缩短，形成下大上小的穹隆顶，如同一眼藻丽的井架。”