洪涝灾害期间，死亡畜禽和各种污物随水流动，积水中夹杂污染物可能含有大量危害健康的细菌、病毒、霉菌等，易引发传染病。为防止传染病发生，确保“大灾之后无大疫”，必须有针对性及时开展灾区的清洁与预防性消毒。各级卫生部门要做好疾病的监测和报告工作，要做到早发现、早诊断、早报告、早隔离、早治疗，防止疫情的发生和扩散。

　　洪涝灾害期间，尤其要关注饮用水的安全。供水单位应强化“供水单位是饮用水安全第一责任人”的意识，承担起饮用水安全的主体责任，健全完善饮用水的污染事故应急预案，同时供水单位应加强供水设施的巡回检查，做好水源设施的卫生防护和水质检测工作，确保饮用水安全。

　　灾区民众要做到，不喝生水或来源不明、被污染的水，不用这些水漱口、洗菜等，尽量喝烧开的水、瓶装水。盛水器具要保持洁净，有条件的要经常消毒，消毒后用干净水冲洗。一旦发生腹泻、腹痛、恶心、呕吐等胃肠道症状时，切勿大意，特别是老年人和儿童，一定要及时就医。自觉保护饮用水水源及环境，在指定地点堆放生活垃圾、倾倒生活污水、大小便。

　　对被洪水淹没过的地铁站、商场、居民房屋等室内区域及时进行彻底的卫生处理，做到先清理、后消毒。在无疫情情况下，应加强通风，保持室内空气流通。

　　室内家具、卫生洁具、办公用品等最好能彻底消毒，并用清水擦拭干净。餐（饮）具清洗后首选煮沸消毒，煮沸时间应在15分钟以上，也可使用消毒剂浸泡消毒，应以清洁水冲洗干净。洪水浸泡过的食品以及腐败变质的食物，都不能食用。部分包装完好的可蒸煮食品应充分加热后食用。

　　民众在参与灾后环境清污消毒、动物尸体处理等工作后均应进行手消毒，可选用有效的手消毒剂搓擦两手，消毒作用时间不少于1分钟。因长时间洪水浸泡造成皮肤红肿、损伤者应及时就医，也可用碘伏等皮肤消毒剂涂抹消毒。